下载大型sra文件的最佳方法

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2017年12月23日 NCBI-SRA和EBI-ENA数据库这是个简短的教程,目的是介绍几种比较方便快捷的 下载SRA、SAM及Fastq文件的方法。欢迎转载,但请注明出处! 2020年9月15日 我们通常用wget或curl下载文件,然而由于NCBI 和EBI 网站都在国外,有时候下载 速度非常慢,如果 最佳生物信息工作环境 Mac下使用Aspera Connect全速 下载大型NCBI文件的方法1,下载安装SRA Toolkit Documentation  高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read 常见的下载方法: aspera 工具下载wget, curl 命令直接下载NCBI官方的SR… 会下载一个名为“SRR_Acc_List.txt”的文件,这个文件里面有所有run的编号  从事生物信息分析的老师和同学一般都会接触SRA数据,下载… 此处为project号),点击"Accession List"键,下载得到SRR List 储存在sra.txt文件中。 得到sra.txt文件如下: 下载NCBI SRA数据的最佳方法. 高通量的原始数据  NCBI-SRA和EBI-ENA数据库这是个简短的教程,目的是介绍几种比较方便快捷的下载SRA、SAM及Fastq文件的方法。欢迎转载,但请注明出处!

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